Парни, попробуйте такой метод.

Откройте терминал, скопируйте и выполните следующую команду:

sudo apt install gxkb

По окончании установки откройте системное меню приложений, найдите приложение — Gxkb, кликом на значок установите его в автозагрузку, чтобы индикатор раскладки в виде флага отображался на панели при входе в систему.

После перезагрузки, раскладка в виде флажков будет всегда. Метод производился на Deepin 15.11